《地下城与勇士》（简称DNF）的剧情围绕“使徒”与“转移”现象展开。在阿拉德大陆的远古时代，十二位拥有强大力量的“使徒”被创造者卡罗索封印于不同次元。然而，随着时间推移，使徒间的冲突与外力干涉导致“转移”频发——使徒被强制移动到阿拉德大陆，每次转移都引发灾难，如毁灭之卡赞的瘟疫和希洛克导致的悲鸣洞穴事件。冒险家们正是从这些事件中觉醒，踏上守护大陆的旅程。
故事的主线起始于赫顿玛尔附近的格兰之森。一场神秘大火烧毁了精灵森林，导致精灵族几近灭绝，并使哥布林、牛头怪等魔物异化暴走。冒险家最初受委托调查异变，逐渐发现幕后黑手与“邪恶的炼金术师”或“试图召唤使徒”的势力有关。随着剧情推进，玩家在洛兰、天空之城等地不断遭遇被转移的使徒，如火焰使徒安徒恩吞噬能源，机械使徒凡内斯操控海洋。
帝国与道德观念的冲突是剧情一大特色。德洛斯帝国为追求力量，秘密支持转移实验，试图利用使徒能量制造兵器，这导致贝尔玛尔公国和虚祖国之间的矛盾加深。冒险家身处各方势力之间，不仅需要击杀使徒，还要做出道德选择：例如，对于被使徒污染的赫尔德的阴谋，不同组织如阿甘左的“使徒亲和派”主张和平沟通，而“猎杀派”如米歇尔则坚持消灭一切威胁。这些对立立场塑造了丰富的情节分支。
使徒之间并非铁板一块。第二使徒哭泣之眼赫尔德被视为关键“策划者”，她为复活创造者，故意诱导冒险家清除其他使徒，以收集能量。这一真相在“时空之门”版本中曝光，使冒险家陷入自我怀疑：自己是否成了赫尔德手中的棋子？随后，暴戾搜捕团等敌方组织登场，他们保护使徒反而成为阻碍。剧情由此从单纯的打怪升级，转入对“宿命与自由”的哲学讨论。
大转移事件是剧情的重大转折。在“大转移”后，阿拉德大陆的地理版图剧变，许多老城镇毁灭或隐藏，新区域如地轨中心、魔界出现。冒险家被卷入使徒间的全面战争，并在第七使徒安徒尼的远古地下城战斗中，首次与巨物型BOSS进行多阶段对决。此后，冒险家获得时空之力，能穿梭于过去与现在，揭露历史真相，比如希洛克如何在悲鸣洞穴中散播精神污染，以及天界为何成为使徒战争的第二战场。
近年剧情的核心转向“次元风暴”与“最终宿命”。冒险家通过魔界进入寂静城，与使徒卡恩、赫尔德正面对峙。玩家角色在无数平行宇宙中获得了“伟大意识”的碎片，成为能影响世界走向的“超越者”。在最新长篇章节“机械崛起”中，冒险家联合天界皇女艾丽婕，对抗机械使徒凡内斯及其创造的战争机器，同时解救被控制的天界人民。这一过程强调团队合作与责任感，呼应了“冒险家是阿拉德的希望”这一主题。
DNF的剧情并非单一线性，而是通过大量支线、再战剧情和背景故事碎片拼合而成。对于玩家而言，理解剧情有助于感受职业与NPC的动机，如在“暗殿骑士”职业任务中能体验希洛克的影响，在“流浪武士”故事中看到镜像阿拉德的毁灭。即便作为百科记录，本文也仅能梳理脉络，真正的乐趣在于亲自走进游戏，探索每一段线索。无论版本如何更新，使徒的传说与冒险家的羁绊始终是DNF最深刻的记忆，也是其生命力长存的根本。